بیمارستان پارسیان دارای 6 اتاق عمل جراحی مجهز در طبقه سوم می باشد.تمامی فیلدهای جراحی اعم از ارتوپدی ، عمومی و لاپاراسکوپی ، نوروسرجری ، اورولوژی ، زنان زایمان ، چشمی ، زیبایی (جراحی بینی) ، ENT و … در اتاق عمل پارسیان فعال می باشد.

اتاق عمل 1 : مربوط به فیلد جراحی اورولوژی و اورژانس می باشد که شامل بهترین تجهیزات بروز بیهوشی و دستگاه سنگ شکن (TUR – TUL) می باشد.

اتاق عمل 2 : مربوط به فیلد زنان می باشد. مجهز به دستگاه لیپ ، کوتر ، کات و وارمر نوزاد و بهترین تجهیزات بروز بیهوشی می باشد.

اتاق عمل 3 : مربوط به فیلد اورتوپدی و لاپاراسکوپی می باشد. اتاق تجهیز شده از تمامی وسایل بروز ارتوپدی شامل دستگاه کوتر ICONIC، دستگاه C-ARM و لاپاراسکوپی  شامل دستگاه آندوسکوپ ، کوتر آندوسکوپ ، دستگاه لیگاشور و بهترین تجهیزات بروز بیهوشی می باشد.

اتاق عمل 4 : مربوط به فیلد نوروسرجری می باشد. اتاق مجهز به بهترین و بروزترین ست های نروسرجری و لوپ چشمی و بهترین تجهیزات بروز بیهوشی می باشد.

اتاق عمل 5 : مربوط به فیلد قلب می باشد که فعال نمی باشد. بیمارستان در صدد خریداری تجهیزات مربوط به این فیلد است.

اتاق عمل 6 : مربوط به فیلد چشم می باشد. تجهیز شده از دستگاه فیکو ، میکروسکوپ چشمی و بروزترین ست ها و ابزار و بهترین تجهیزات بروز بیهوشی  می باشد.

از تجهیزات مهم و بروز اتاق عمل می توان اتو کلاو و فست کلاو را نام برد.

همچنین اتاق عمل دارای یک فضای بزرگ برای ریکاوری مریض می باشد که شامل 7 برانکارد است. ریکاوری به تمامی تجهیزات نوین مجهز می باشد.

یک فضایی از اتاق عمل مربوط به آماده سازی مریض جهت جراحی می باشد که مریض قبل از عمل جراحی در این محیط امن و آرامش بخش قرار می گیرد تا از استرس آن کاهش یابد

سیستم CSR و استریلیزاسیون بیمارستان مطابق با آخرین استانداردهای بیمارستان های نوین و ایمن دنیا تجهیز و راه اندازی شده بطوری که وسایل استریل شده از طریق یک آسانسور بصورت مستقیم و بدون توقف وارد بخش اتاق عمل می شود.